1901 年6 月2 日，马偕博士因为喉癌逝世，最后安葬于淡江中学角落的墓园。此处原为淡水外侨墓园，马偕逝世后家人遵其遗嘱，以一堵围墙将其墓地与其他洋人之墓地隔开，用以表明马偕是为台湾人。
得以安葬于此墓园者，多为马偕家人与嫡系学生。园区当中，墓碑较高者（如烛台）是马偕之墓，其外观形式与众不同。右边是妻子张聪明之墓，合乎台湾传统男左女右习惯；左边是安葬儿媳-偕叡廉夫妇，他们于 1914 年创办淡江中学。外围周边则是学生、姻亲之墓。
马偕夫妇的墓碑，立于墓穴之后方，外观上有三阶的台座，台座上为墓碑，上面书写着马偕生平及来台日期，墓碑上方覆盖着一石雕平台，平台有如墓之屋顶，其上再立上一支方尖型的碑，，使得整座墓看起来非常壮丽。
墓碑正面是英文和河洛话罗马拼音，背面是汉字，上面并记载为马偕学生所立。依墓碑石质判断，应属于观音山石，质地坚硬，色泽呈青灰色，雕纹虽经过百年岁月风蚀，仍十分清晰完整。马偕墓园之设计者是吴威廉牧师，为继马偕之后，在北部基督长老教会史上极重要人物。
此墓园目前由淡江中学管理，已被政府列为三级古迹。